یکی از مشکلات اساسی خانه های نسقی، نداشتن امکانات کافی در حد و اندازه خانه های سند دار است، اما این جمله به معنای معماری ضعیف یا نداشتن یک سری امکانات مثل سایر خانه ها نیست. چه بسیار خانه های نسقی هستند که از جدیدترین مصالح ساختمانی مانند کنف کاری سقف، نورپردازی زیبا، کابینت ممبران و… برخوردارند، اما در حقیقت مجوزهای لازم در هنگام ساخت را دریافت نکرده اند و علاوه بر این دو خطر بزرگ متقاضیان به خرید اینگونه خانه ها را تهدید می کند؛ فروش ملک به چندین نفر از سوی مالک و دیگری مشخص نبودن مالک اصلی ملک.