آیت الله ملامحمد خمامی از شخصیت های مهم و متنفذ گیلان به شمار می آمد و به علت نقش فعال در حوادث دینی، اجتماعی و سیاسی گیلان، حکام، مجتهدان عصر و مردم حرمت خاصی برای او قائل بودند.
مخالفت آیت الله ملامحمد خمامی با مشروطه‌چیان گیلان بر سر انتخاب وکلای مجلس و دیگر مسائل، به هجرت معترضانه ایشان در اواسط مشروطه اول به تهران انجامید. اوج بحران زمانی بود که شیخ شهید در اواسط مشروطه اول به حضرت عبدالعظیم‌الحسنی(ع) پناهنده شد. آیت الله خمامی نیز در واقع به‌دلیل حمایت صریح و قاطع از حرکت اصلاحی شیخ‌فضل‌الله واکنش بسیار تند مشروطه‌چیان را نسبت به خویش برانگیخت.
