پس از شهادت سید یونس خانواده او به دیدار امام خمینی(ره) نایل می‌شوند امام پس از عرض تسلیت و تفقد و اظهار همدردی چون پدر شهید سید یونس را در حال گریه مشاهده می‌کند به ایشان می‌فرماید: این گریه مال شما نیست! این گریه برای من است که بهترین عزیزم را از دست دادم!
رئیس بنیاد تاریخ‌پژوهی و دانشنامه انقلاب اسلامی ایران با بیان اینکه مخالفان انقلاب در مقابل دشمن تعظیم نمی کنند، گفت: قرآن اجازه نمی دهد مسلمان با دشمن مذاکره کند و راه انقلاب از هرگونه سازش جدا است.
در بهمن ماه ۱۳۴۱ آیت الله بحرالعلوم رشتی و آیت الله ضیابری به زندان افتادند امام خمینی که نگران حال آنها بود به آنها تلگراف ارسال کرد، بعد از آزادی، آیت الله بحرالعلوم دیداری محرمانه با امام خمینی در قم داشت که در واقع بیعت او با امام خمینی برای ادامه مبارزات بود.
