در بهمن ماه ۱۳۴۱ آیت الله بحرالعلوم رشتی و آیت الله ضیابری به زندان افتادند امام خمینی که نگران حال آنها بود به آنها تلگراف ارسال کرد، بعد از آزادی، آیت الله بحرالعلوم دیداری محرمانه با امام خمینی در قم داشت که در واقع بیعت او با امام خمینی برای ادامه مبارزات بود.
