وی در ارتباط با استیضاح وزیر علوم، با بیان اینکه مجلس جریان افراطی‌گری را در دانشگاه‌ها استیضاح کرد، افزود: نمایندگان مردم مصلحت بر این دانستند که این استیضاح انجام شود، به‌طور قطع بحث ما بر شخص وزیر نیست، بحث ما جریانی است که بر فضای علمی کشور حاکم شده است.

آیت‌الله علم‌الهدی بیان کرد: اگر تسامح در محیط دانشگاه حاکم باشد و جریان آکادمیک کشور به یک جریان بی‌بندوبار تبدیل شود، به‌طور قطع این بزرگ‌ترین فاجعه و مشکل است، پس به‌طور قطع مشکل اصلی بر سر جریان است.

امام جمعه مشهد افزود: این جریان در عرصه وزارت علوم حاکم شد و عاقبت آن گریبان وزیر علوم را گرفت، البته شاید وزیر فردی لایق باشد ولی بحث اصلی بر سر جریان است.