طی سالهای گذشته علی مطهری بارها خواستار آزادی زندانیان سیاسی شده و تصریح کرده است که باید تکلیف آقایان موسوی و کروبی نیز روشن شود. نماینده مردم بر این باور است که زندانیان سیاسی که اکثر آنها جرمی جز انتقاد ندارند آزاد شوند.
عضو مجلس خبرگان رهبری گفت: اگر در فتنه ۸۸ کسانی در صدد براندازی نظام برآمدند که سال‌ها برای انقلاب زحمت کشیده بودند، ناشی از تفکر اشتباهی بود که از همان اول داشتند و نظامی که ولایت فقیه در رأس آن باشد مورد قبولشان نبود.
