رهبر معظم انقلاب در پیامی درگذشت آیت‌الله محمد یزدی را تسلیت گفته و بیان داشتند: ایمان راسخ به مبانی انقلاب و استقامت در این راه و غیرت دینی و انقلابی، نشانه‌های بارز دیگری از این شخصیت مکرم بود و امید است این وزن سنگین ذخیره معنوی مایه علو درجات ایشان باشد.
در ایام غبارآلود فتنه، درحالی که برخی خواص روزه سکوت گرفته و اقدامات فتنه گران را محکوم نکردند، آیت‌الله یزدی از جمله کسانی بود که به صراحت، از همان روزهای نخست فتنه ۸۸ را محکوم کرد.
سخنگوی شورای نگهبان با انتشار پیامی در فضای مجازی نوشت: حضور آیت‌الله یزدی در شورای نگهبان سرمایه‌ای بزرگ و ارزشمند برای این نهاد بود و خلأ حضور ایشان در جلسات ماه‌های اخیر به وضوح احساس می‌شد.
عضو حقوقدان شورای نگهبان در صفحه شخصی‌اش در فضای مجازی نوشته است که آیت‌الله یزدی گفت: این خوب است که جنسیت مانع حضور زنان در انتخابات خبرگان نیست و این حق زنان است که وارد چنین مجامعی شوند
آیت الله یزدی با اشاره به این که در مساله احراز اجتهاد داوطلبان نمایندگی خبرگان قانون تکلیف را مشخص کرده است، گفت: فقهای شورای نگهبان تحت هیچ فشاری درباره هیچ کس حاضر نیستند نظر بدهند و ما غیر از قانون هیچ چیز دیگر را قبول نداریم.
رئیس مجلس خبرگان رهبری گفت: باید یک گروه حقیقت‌یاب از طرف جهان اسلام برای پیگیری این مسئله تشکیل شود، یا دست‌کم گروهی به نمایندگی از سازمان همکاری‌های اسلامی این ماموریت را انجام دهد.
